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MONAI,NVIDIA程序员为医学研究者免费打工了

2020-04-27 来源:米文动力

最近我们注意到一个叫做MONAI(莫奈??)的开源项目在Github上线了。地址:https://github.com/Project-MONAI/MONAI

1.jpg

虽然目前中文媒体还没有看到有规模的宣传,但是在NVIDIA的官网已经做了相关介绍[1]。根据目前的信息,这应该是一个专门为医疗行业设计的深度学习框架,基于Pytorch,并且需要编程实现……把Research变得更加简单……的工具……


虽然官网号称的是“ NVIDIA和伦敦国王学院与中国科学院,德国癌症研究中心,Kitware,MGH和BWH临床数据科学中心,斯坦福大学和慕尼黑工业大学的咨询委员会合作,共同领导了这项计划。”但我们从Github的日志里面,可以得到如下信息。


使用下列命令,我们可以得到前十的贡献者。

git log --pretty='%ae' | sort | uniq -c | sort -k1 -n -r | head -n 10

65 wenqil@nvidia.com

35 nma@nvidia.com

 11 madil@nvidia.com

 9 56449156+Project-MONAI@users.noreply.github.com

 6 17726042+ericspod@users.noreply.github.com

 4 isaacy@nvidia.com

 4 56449156+MONAI-Project@users.noreply.github.com

 3 ben.murray@gmail.com

 1 mpcmvp@163.com

 1 mhubii@users.noreply.github.com


可以看到,前三都是nvidia.com的邮箱。因此,这个“共同领导”,比较大的可能是NVIDIA贡献了代码,而医疗机构提供了数据(此处需点题)。

WechatIMG675.png


我们为什么会对这个事情感兴趣呢?


首先,如宣传中所说” It’s never been more important to put powerful AI tools in the hands of the world’s leading medical researchers.”。我们也同样坚信AI是一个重要的工具,而真正让AI发挥作用的,则是使用AI的人。这些使用AI的人,往往是数据的拥有者。最终数据和AI将在数据拥有者身上形成闭环,来创造更大的价值。


其次,我们注意到Github的TOP贡献者中的名字,很多看起来都是同胞兄弟。Wenqi Li, Nic Ma,Isaac Yang;看起来是一个中国人的同胞团队贡献的项目。


同胞贡献的这么有意义的项目,当然必须顶啊!国内的科研机构们,一(hao)起(yang)合作(mao)的机会大家不要放过啊。转~


那这个MONAI到底提供了怎样的功能呢?


首先它是基于Pytorch的,其次是要Coding才能使用的…… 有人要问,那我为毛不直接用Pytorch啊?


但其实这个项目的核心贡献,看上去是在这边。(虽然我对医疗是真的不懂……)

WechatIMG676.jpeg


通过Search可以知道,医疗影像数据的增强和预处理等都非常的麻烦,MONAI在这方面提供了很多现成的库,更加方便Researcher们使用。并且针对医学影响方面的训练也进行了网络和损失函数方面的优化。这样Researcher们就能够非常简单的更加专注在数据了……(听上去好像还是非常复杂的样子)


然后随着项目还提供了不少IPYNB的文档,来描述如何使用对应的API。仍然对研究者的编程能力提出了一定的挑战。但我实在是偷懒,连Docker都没有去运行……


总之这个项目其实继承了NVIDIA一直以来的风格,和DLI的基础差不多(我还是打开MedNIST看了一下滴)。但我实在不太确定现在医学研究人员是否真的能够适应这么Engineer的风格,毕竟跨界还是有一定难度的,感兴趣的朋友也可以直接通过Github和官网的链接来进行提问,毕竟像是中国团队的作品,将来中文的文档也相当可期。


那用了MONAI以后,Researcher们到底能少写多少代码呢?


对不起!我·并·没·有·去·对·比!而且偷懒不是这么偷的好么?

WechatIMG677.png

看目前的路线图,再次反映了国人的谦虚和低调(按这个速度,2022年才会到v1.0)。具体后续会怎么进化,我们还是要进一步关注项目的消息。

WechatIMG678.jpeg

对项目感兴趣的同学可以对该项目(https://github.com/Project-MONAI/MONAI)加星和三连,毕竟NVIDIA工程师再次开始为医疗行业免费打工了。


参考链接:

[1]https://blogs.nvidia.com/blog/2020/04/21/monai-open-source-framework-ai-healthcare/

 



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